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dc.contributor.authorPérez Pérez, Juan C.-
dc.contributor.authorMontoya Ruiz, Carolina-
dc.contributor.authorArroyave Sierra, Esteban-
dc.contributor.authorPaternina, Luis E.-
dc.contributor.authorRodas, Juan D.-
dc.date.accessioned2019-03-06T21:36:09Z-
dc.date.available2019-03-06T21:36:09Z-
dc.date.issued2017-11-24-
dc.identifier.citationPérez J, Montoya C, Arroyave E, Paternina L, Rodas J. Design and analytical validation of a duplex PCR for Ehrlichia and Rickettsia detection in ticks. Rev Colomb Cienc Pecu 2018; 31(4):285-294.es_ES
dc.identifier.issn01200690-
dc.identifier.issn22562958 E-
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/10495/10723-
dc.descriptionBackground: Ehrlichia and Rickettsia are two major rickettsial genera transmitted by ticks that affect a number of wild and domestic animal species and human populations around the world. Objective: To design and validate a duplex PCR for Ehrlichia and Rickettsia in ticks. Methods:Assay validation included testing for sensitivity,specificity, reproducibility, and robustness of the PCR. The groELand 23sr RNAgenes were used for Ehrlichia and Rickettsia, respectively. Results: The limit of detection was one hundred gene copies per 50 μLof reaction for Ehrlichia spp, and one gene copy of Rickettsia per 50 μL of reaction. In general, the primers of the test only amplified in silico those bacterial agents for which they were originally designed, with the exception of the primers for Rickettsia that also amplified Methylocystis sp. The test was reproducible (intermediate precision) 96.7% of the times for both agents. The test was robust enough to tolerate concentration changes of all reagents with the exception of Taq DNA polymerase. Conclusions: The validation results indicated that this PCR is useful for detection in both bacterial genera and it is a good candidate for diagnostic validation.es_ES
dc.description.abstractAntecedentes: Ehrlichia spp. y Rickettsia spp.son dos de los principales géneros rickettsiales transmitidos por garrapatas que afectan a animales silvestres, domésticos y humanos alrededor del mundo. Objetivo: diseñar y validar una prueba PCR duplex para Ehrlichia y Rickettsia en garrapatas. Métodos: la validación de la prueba incluyó ensayos de sensibilidad, especificidad, reproducibilidad y robustez. En la PCR se usó groEL y ARNr 23S como genes blanco para Ehrlichia y Rickettsia, respectivamente. Resultados: el límite de detección fue de 100 copias del gen por 50 μL de reacción para Ehrlichia spp y una copia del gen de Rickettsia por 50 μLde reacción. En general, los cebadores de la prueba solo amplificaron in silico los agentes bacterianos para los cuales fueron originalmente diseñados, con la excepción de los cebadores de Rickettsia que también amplificaron Methylocystis sp. La prueba fue reproducible (precisión intermedia) en un 96.7% de las veces para ambos agentes. La prueba fue suficientemente robusta como para tolerar cambios de concentración de los diferentes reactivos, con excepción de la Taq DNA polimerasa. Conclusión: los resultados de validación indican que la PCR es útil para detectar ambos géneros bacterianos y podría usarse para validación diagnóstica.es_ES
dc.format.extent245-294es_ES
dc.format.mimetypeapplication/pdfes_ES
dc.language.isoenes_ES
dc.publisherUniversidad de Antioquia, Facultad de Ciencias Agrariases_ES
dc.type.hasversioninfo:eu-repo/semantics/publishedVersiones_ES
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccesses_ES
dc.sourceinstname: Universidad de Antioquiaes_ES
dc.sourcereponame: Repositorio Institucional Universidad de Antioquiaes_ES
dc.sourceRevista Colombiana de Ciencias Pecuariases_ES
dc.subjectExclusivenesses_ES
dc.subjectgroELes_ES
dc.subjectInclusivenesses_ES
dc.subjectRobustnesses_ES
dc.subjectrRNA 23Ses_ES
dc.titleDesign and analytical validation of a duplex PCR for Ehrlichia and Rickettsia detection in tickses_ES
dc.title.alternativeDiseño y validación analítica de una PCR duplex para la detección de Ehrlichia y Rickettsia en garrapatases_ES
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/articlees_ES
dc.publisher.groupCENTAUROes_ES
dc.publisher.departamentFacultad de Ciencias Agrariases_ES
dc.relation.volumen31es_ES
dc.relation.numero4es_ES
dc.source.tituloRevistaAbreviadaRev Colomb Cienc Pecues_ES
Aparece en las colecciones: Ciencias Agrarias

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